化糞池若長期未清理，容易產生惡臭、管線回堵，甚至造成污水外溢影響環境衛生。
一般家庭建議每1～2年清潔一次，若是餐廳、宿舍或使用人口多的場所，則應縮短為半年到一年清理一次。
定期清潔不僅能避免突發阻塞，也能降低細菌孳生風險。專業化糞池清潔會搭配抽取與沖洗作業，確保池內污泥與沉積物完全清除，維持系統正常運作。